Innehåll
DNA
Deoxyribonukleinsyra och proteiner. DNA organiseras i enheter som kallas gener, som var och en kodar för en viss RNA eller proteinsekvens. Gener studeras för att lära sig om biologisk struktur och funktion, evolution, sjukdom och många andra aspekter av levande system. För att studera gener i detalj måste DNA isoleras och renas från celler av intresse.
DNA-extraktion
Även om DNA från en enda cell kan extraheras och studeras är det inte tillräckligt att se med blotta ögat. För att få en mängd som är tillräcklig för spolning, desto fler celler måste du arbeta med desto bättre (många miljoner).
Exakta protokoll varierar avsevärt för att ta hänsyn till de unika egenskaperna hos specifika prover, men de allmänna stegen är homogenisering, lysering, matsmältning, separering och uppsamling. Förfarandet utförs bäst i ett litet (beroende på provets storlek) glas eller plaströr.
Ett prov blandas i allmänhet eller slipas för att grundligt separera cellerna från varandra. Detta gör cellingredienserna mer tillgängliga för reagenserna som följer. Detergent eller enzymer tillsättes sedan till homogenatet för att lysa cellmembranen (och kärnmembranen om cellerna är eukaryota) för att frigöra DNA. Vid denna tidpunkt omges DNA av proteiner, lipider, kolhydrater --- allt annat som fanns i cellerna.
Ytterligare en enzymatisk matsmältning kan vara nödvändig för att bryta ner proteiner så att de inte binder till DNA och stör deras uppsamling. DNA separeras från resten av cellinnehållet genom tillsats av kall, ren, etyl- eller isopropylalkohol. DNA är inte lösligt i dessa alkoholer så det kommer att kondensera för att försöka minimera kontakten med alkoholen. Det kondenserade DNA: et samlades sedan upp, vanligtvis genom centrifugering --- eller spolning.
DNA-spolning
DNA-insamling genom spolning är effektiv när en stor mängd DNA erhålls från ett extraktionsförfarande. Det är också en utmärkt demonstrationsmetod, eftersom en imponerande trassel av rent DNA är tydligt synlig.
För att spola DNA måste separationssteget utföras noggrant. Om det inte var en del av lysisreagensblandningen som tidigare tillsatts, måste en koncentrerad saltlösning (natriumklorid) sättas till lösningen innan alkoholtillsatssteget. Den kalla alkoholen hälls långsamt ner på provrörets sida för att bilda ett skikt ovanpå den vattenhaltiga lösningen och undviker blandning. Om det görs korrekt kommer alkoholen att bilda sitt eget skikt ovanpå det salta skiktet. Sedan kommer spolningen.
För att samla upp DNA från det salta lagret, placera försiktigt en glasrörstång med alkoholskiktet tills det rör vid botten av röret. Snurra långsamt stången mellan fingrarna medan du tittar på gränssnittet mellan de två lagren. Om tillräckligt med DNA finns, kommer det att klumpas samman vid gränssnittet mellan skikten för att bilda en mjölkaktig genomskinlig massa. Snurra stången för att linda DNA: n runt den (det är den spolande delen) och dra den ut ur röret. DNA kan överföras till ett annat rör med ren alkohol för lagring eller vidare analys.