Innehåll
- Hur bestäms aminosyrasekvensen
- Att välja aminosyror
- Olika möjligheter för proteiner
- Skillnaden i ett protein
- Varför beställningen är viktig
Proteiner är bland de viktigaste kemikalierna för allt liv på planeten. Strukturen hos proteiner kan variera kraftigt. Varje protein består dock av många av de 20 olika aminosyrorna. I likhet med bokstäverna i alfabetet, spelar ordningen på aminosyrorna i ett protein en viktig roll i hur den slutliga strukturen kommer att fungera. Proteiner kan vara hundratals aminosyror långa, så möjligheterna är nästan oändliga som vi kommer att undersöka inom.
Hur bestäms aminosyrasekvensen
Du kanske har en allmän uppfattning om att DNA är den genetiska basen för allt du är. Vad du kanske inte inser är att DNA: s enda funktion är att i slutändan bestämma ordningen på aminosyror som går in i alla proteiner som gör dig till den du är. DNA är helt enkelt långa delar av fyra nukleotider som upprepas om och om igen. Dessa fyra nukleotider är adenin, tymin, guanin och cytosin och representeras vanligtvis av bokstäverna ATGC. Oavsett hur lång tid ditt DNA är, läser "kroppen" dessa nukleotider i grupper om tre och var tredje nukleotider för en specifik aminosyra. Så en sekvens på 300 nukleotider skulle i slutändan koda för ett 100 aminosyralångt protein.
Att välja aminosyror
I slutändan skjuter ditt DNA av mindre kopior av sig själv, känt som budbärar-RNA eller mRNA, som går till ribosomerna i dina celler där proteiner tillverkas. RNA använder samma adenin, guanin och cytosin som DNA men använder en kemikalie som kallas uracil istället för tymin. Om du spelar med bokstäverna A, U, G och C och ordnar dem i grupper om tre, kommer du att upptäcka att det finns 64 möjliga kombinationer med distinkt ordning. Varje grupp av tre är känd som ett kodon. Forskare har utvecklat ett diagram som låter dig se vilken aminosyra en specifik kodon koder för. Din kropp vet att om mRNA läser "CCU", bör en aminosyra som kallas prolin tillsättas på den platsen, men om den läser "CUC", bör aminosyran leucin läggas till. Se referensavsnittet längst ner på sidan för att se ett helt kodkart.
Olika möjligheter för proteiner
Ett protein kan helt enkelt vara en sträng av aminosyror, men vissa komplicerade proteiner är faktiskt flera strängar av aminosyror som är sammanfogade. Dessutom är proteiner av olika längder, varav vissa är bara några få aminosyror långa och andra är över 100 aminosyror långa. Dessutom använder inte alla proteiner alla tjugo aminosyror. Ett protein kan möjligen vara hundra aminosyror långt men bara använda åtta eller tio olika aminosyror. På grund av alla dessa möjligheter finns det bokstavligen ett oändligt antal möjliga permutationer som kan vara ett protein. I naturen kan det finnas ett begränsat antal proteiner; antalet verkliga proteiner finns emellertid i miljarder, om inte mer.
Skillnaden i ett protein
Alla levande organismer har DNA och alla använder samma 20 aminosyror för att skapa de proteiner som är nödvändiga för livet. Så det kan sägas att bakterier, växter, flugor och människor alla delar samma grundläggande byggstenar i livet. Den enda skillnaden mellan en fluga och en människa är DNA: s ordning och därför ordningen på proteinerna. Även inom människor varierar proteiner drastiskt. Protein utgör vårt hår och naglar, men det utgör också enzymerna i vår saliv. Proteiner utgör vårt hjärta och även vår lever. Olika strukturella och funktionella användningar för protein är nästan obegränsade.
Varför beställningen är viktig
Ordningen på aminosyror är lika viktig för proteiner som ordningen på bokstäver är viktig för ord. Tänk på termen "Santa" och allt som är associerat med det. Att helt enkelt ordna om bokstäverna kan ge uttrycket "Satan", som har drastiskt olika konnotationer. Det är inte annorlunda för aminosyror. Varje aminosyra har ett annat sätt att reagera med de andra. Vissa gillar vatten, andra hatar vatten, och de olika aminosyrorna kan interagera som poler på en magnet där vissa lockar och andra stöter. På molekylnivå kondenseras aminosyrorna till en spiral- eller arkliknande form. Om aminosyrorna inte gillar att vara sida vid sida kan detta drastiskt förändra formen på molekylen. I slutändan är det formen på molekylen som faktiskt passar. Amylas, ett protein i din saliv, kan börja bryta ner kolhydrater i din mat, men det kan inte röra fett. Pepsin, ett protein i magsafterna, kan bryta ner proteiner, men det kan inte bryta ner kolhydrater. Aminosyrornas ordning ger proteinet sin struktur och strukturen ger proteinet sin funktion.