Innehåll
Föreställ dig att du har två tunna trådar, vardera cirka 3 1/4 fot långa, hålls samman av utdrag av ett vattenavvisande material för att bilda en tråd. Föreställ dig nu att montera tråden i en vattenfylld behållare med några mikrometer i diameter. Dessa är de villkor som människans DNA står inför i en cellkärna. DNA: s kemiska smink, tillsammans med proteinerna, tvinnar DNA: s två ytterkanter till en spiralform, eller spiral, som hjälper DNA att passa in i en liten kärna.
Storlek
Inuti en cellkärna är DNA en tätt spiral, trådliknande molekyl. Kärnor och DNA-molekyler varierar i storlek mellan varelser och celltyper. I varje fall förblir ett faktum konsekvent: sträckt platt, ett celler-DNA skulle exponentiellt vara längre än diametern på dess kärna. Rymdbegränsningarna kräver vridning för att göra DNA: t mer kompakt, och kemi förklarar hur vridningen sker.
Kemi
DNA är en stor molekyl byggd av mindre molekyler av tre olika kemiska ingredienser: socker, fosfat och kvävehaltiga baser. Sockret och fosfatet är beläget på DNA-molekylens ytterkanter, med baserna arrangerade mellan dem som en stege. Med tanke på att vätskorna i våra celler är vattenbaserade, är denna struktur meningsfull: socker och fosfat är både hydrofila eller vattenälskande, medan baserna är hydrofoba eller vattenfruktiga.
Strukturera
••• Hemera Technologies / AbleStock.com / Getty ImagesI stället för en stege ska du bilda ett tvinnat rep. Vridningarna fäster trådarna ihop nära varandra och lämnar lite utrymme mellan dem. DNA-molekylen vrider på liknande sätt för att krympa utrymmen mellan de hydrofoba baserna på insidan. Spiralformen avskräcker vatten från att rinna mellan dem, och lämnar samtidigt utrymme för atomerna hos varje kemisk ingrediens att passa utan att överlappa eller störa.
Stacking
Baserna hydrofobisk reaktion är inte den enda kemiska händelsen som påverkar vridning av DNA.De kvävehaltiga baserna som sitter tvärs över varandra på DNA: s två strängar lockar varandra, men en annan attraktiv kraft, kallad staplingskraften, spelas också. Staplingskraften lockar baserna över eller under varandra på samma tråd. Duke University-forskare har lärt sig genom att syntetisera DNA-molekyler som består av bara en bas att varje bas utövar en annan staplingskraft och därmed bidrar till DNA: s spiralform.
proteiner
I vissa fall kan proteiner orsaka att delar av DNA slingras ännu hårdare och bildar så kallade supercoils. Till exempel skapar enzymer som hjälper till DNA-replikering ytterligare vändningar när de reser DNA-strängen. Ett protein som kallas 13S-kondensin verkar också leda till supercoils i DNA strax före celldelning, en studie från University of California 1999, Berkeley, avslöjade. Forskare fortsätter att undersöka dessa proteiner i hopp om att ytterligare förstå vändningarna i DNA-dubbelhelixen.