Innehåll
- Genotypdefinition
- Att känna till genotypen: Punnett Square
- Polymeraskedjereaktion
- Hybridiseringssond
- Direkt DNA-sekvensering
Termen genotyp avser den kompletta genetiska sammansättningen av en organisme. Det används också för att beskriva de olika variationerna av en gen, känd som alleler. Människor har två alleler för varje genetisk position, eller lokus.Sammantaget betraktas varje par av alleler som en specifik genotyp.
Att känna till genotypen eller ett genotyp exempel på en individ kan vara viktigt för att förstå genetiskt uttryck, diagnostisera sjukdomar, lära sig om genetiska mutationer och mer.
Genotypdefinition
Låt oss börja med en specifik definition av genotyp. En individs genotyp är den ärftliga genetiska informationen som personen har. Detta hänvisar till dina gener, DNA, alleler, etc i ett alltomfattande ord. Ett exempel skulle kunna beskriva en blommafärggenotyp som RR (vilket betyder att de har två "röda" alleler, RR, för sin färg) eller Rr (en "röd" allel, R och en "rosa" allel, r, för färg) .
Din fenotyp, å andra sidan, är vad och individ fysiskt visar att det bestäms av den genotyp de har. Medan två individer kan ha samma fenotyp kan de ha helt olika genotyper. Genom att följa blommexemplet från tidigare verkar både RR- och Rr-blommorna vara röda eftersom röd är dominerande över rosa. De skiljer sig emellertid i sin genotyp eftersom en är homozygot (RR) och en är heterozygot (Rr).
Läs mer om definitionen, alleler och exempel på genotyper.
Att känna till genotypen: Punnett Square
En Punnett-kvadrat är ett av de enklaste sätten att bestämma genotyp. Torget är faktiskt ett minikart som används för att bestämma den potentiella genotypen för ett avkomma med avseende på speciell egenskap.
Om du vill skapa en Punnett-kvadrat skriver du alla möjliga alleler över toppen av fyrkanten för en förälder och alla möjliga alleler för den andra föräldern nere på vänster sida. Varje listad allel blir antingen en kolumn, för toppalleler eller en rad, för vänster-alleler, inuti torget. Kvadratet fylls i när du skriver ner alleler uppifrån i sina respektive kolumner och sedan skriver ner alleler från sidan i respektive rader och skapar en kvadrat full av potentiella genotyper.
Ett genotypexempel med Punnett-torget är de klassiska ärtexperimenten utförda av Gregor Mendel. Kolla in specifika exempel på genotyp och Punnett-rutor här.
Polymeraskedjereaktion
Utvecklad under 1980-talet genererar PCR (polymeraskedjereaktion) en specifik DNA-bas baserad på en mallsträng. Förutom en mallsträng är DNA-polymeras, nukleotider och korta bitar av enkelsträngat DNA nödvändigt för en PCR-reaktion.
Vid en viss punkt börjar PCR-reaktionen att generera kopior exponentiellt, och endast under denna fas är det möjligt att bestämma den ursprungliga mängden av målsekvensen i provet. Metoden används för sekvensering, kloning och genteknik.
Läs mer om skillnaderna mellan PCR-kloning.
Hybridiseringssond
En hybridiseringssond används för att bestämma om en fysisk egenskap beror på genotyp. Processen börjar med fullständig nedbrytning av DNA som ska analyseras följt av dess överföring till ett filtermembran. Sedan läggs sonden till filtret och får binda till en målsekvens.
Efter cirka 24 timmar tvättas filtret för att avlägsna eventuell icke bunden sond. Ett hybridiseringsprov kan också användas för att bestämma effektiviteten av en kloningsprocess eller för att ta reda på antalet kopior av en specifik gen.
Direkt DNA-sekvensering
Human Genome Project ledde till utvecklingen av ett antal kraftfulla DNA-sekvenseringsverktyg. Förutom att avkoda hela genomet Homo sapiens, har dessa verktyg gjort det möjligt för forskare att sekvensera de kompletta genomerna av många andra organismer, inklusive möss, råttor och ris. Avancerade sekvenseringsverktyg gör det möjligt för dagens genetiker att jämföra och manipulera stora mängder DNA snabbt och billigt.
Detta kommer att möjliggöra att fastställa genetikens roll i sjukdomskänslighet, organismernas genetiska respons på miljöstimuleringar och spåra utvecklingen av en egenskap eller art, enligt National Human Genome Research Institute.