Innehåll
Gelelektrofores är en metod som används i laboratorier för att mäta och sortera DNA-strängar. Det är nödvändigt eftersom DNA under normala förhållanden är för litet för att manipulera, även när det ses med de flesta mikroskop. Gelelektroforeslaboratoriumet använder en relativt enkel procedur, och samma grundteknik kan också användas för att separera enskilda proteiner.
Gelmatrisen
För att påbörja gelelektroforesproceduren måste du först skapa gelén. Vanligtvis tillverkas geler i tunna skikt med ett ämne som kallas agaros. Pulveriserad agaros placeras i en kolv, följt av en saltvattenlösning som kallas en buffert. Denna blandning av agaros och buffert upphettas tills de två substanserna smälter ihop, hälls sedan i en formform. En anordning som kallas en kam placeras sedan i ena änden av formen innan gelén svalnar. När gelén kyls avlägsnas kammen, vilket lämnar små luckor som kommer att användas för att hålla DNA-prover.
En speciell egenskap hos den kylda agarosblandningen (kallas en gelmatris) härrör från det faktum att den skapas med saltvatten. När den elektrifieras kommer matrisen att bli ledande, vilket gör att el kan strömma längs sin längd. En annan speciell egenskap hos gelmatrisen är närvaron av regelbundna mikroskopiska hål. Dessa hål tillåter DNA-strängar att röra sig genom gelmatrisen och underlätta sorteringsprocessen.
Elektroforeskammaren
Ditt nästa steg är att skapa en elektroforeskammare. Detta är en liten rektangulär låda med kabel och en positiv och negativ elektrisk anslutning i vardera änden. Kammare är vanligtvis grunt, tillräckligt små för att passa på en bordsskiva och byggda av tydliga material som plexiglas.
Saltvattenlösning hälls i botten av elektroforeskammaren och gelmatrisen nedsänkts något i denna lösning. Saltvattnet tjänar två syften: att hjälpa flödet av elektricitet och hålla gelmatrisen fuktig. Eftersom DNA drivs av en negativ laddning, placera din matris så att dina prover kommer att placeras bredvid din negativa elektriska anslutning.
Förbereda DNA
DNA-prover bereds sedan. Eftersom DNA i lösning bara är omöjligt att se läggs ett färgämne som kallas en laddningsbuffert till varje enskilt prov. Detta medel förtjockar också DNA-lösningen, vilket gör den mindre rinnande och mer användbar. Överför ett prov av DNA-lösning med en pipett till varje växlande lucka i gelmatrisen. I den tomma luckan mellan varje prov, placera en lösning av DNA vars längd du redan vet (kallas DNA-standard) för experimentkontroll och jämförelse.
Slå på strömmen
Starta nu din elektroforeskammare. Under negativ kraft kommer dina DNA-prover att tvingas över kammarens längd. Små DNA-strängar kommer att röra sig snabbare genom gelmatrisen och på kort tid kommer de att skilja sig från längre, långsammare strängar. Färgämnet i färgämnet låter dig följa DNA-spåret. Du kommer inte att kunna se enskilda DNA-strängar, men strängar av samma längd klumpas samman.
Sista steg
När DNA: n sorteras bort tas matrisen bort från elektroforeskammaren. DNA färgas sedan för att möjliggöra enklare mätning och undersökning.