Innehåll
- Fördel: Känslighet
- Fördel: Specificitet
- Nackdel: utsatt för falska eller subjektiva resultat
- Nackdel: hög kostnad och teknisk efterfrågan
Western blot, en analytisk teknik som används för att fastställa ett specifikt protein i ett givet prov, använder förmågan hos ett enzym eller fluorescensmärkt primär antikropp att binda till dess specifika antigen. Det är en trestegsprocess som börjar med gelelektrofores, följt av membranblotting och sondering med antikroppar. Proteindetektion kan vara direkt eller indirekt, varvid den senare använder en märkt sekundär antikropp riktad mot den primära. Även om Western blot är accepterad som en rutinmässig proteinanalyssteknik, såväl begränsningar som fördelar
Fördel: Känslighet
Ett av de största argumenten för Western blot är dess känslighet. På grund av dess förmåga att detektera så lite som 0,1 nanogram protein i ett prov kan tekniken teoretiskt tjäna som ett effektivt tidigt diagnosverktyg, och även avkänna det minsta immunogena svaret från ett virus eller bakterier i ett patientprov. En indirekt western blot bygger vidare på denna känslighet från den sekundära antikroppens förmåga att förstärka intensiteten hos signalen som detekteras av bildsystemet. Större känslighet innebär att färre antikroppar behövs för testning, vilket minskar laboratoriekostnaderna avsevärt.
Fördel: Specificitet
Western blot-tekniken är skyldig två stora bidragande faktorer. Först sorterar gelelektrofores ett prov i proteiner av olika storlek, laddning och konformation. Denna process är i sig ett stort steg mot detektion, eftersom band som bildas i gelén redan ger ledtrådar om storleken på proteinet eller polypeptiden av intresse. Specificiteten för antikropp-antigeninteraktion fungerar som den andra stora faktorn. Eftersom specifika antikroppar visar affinitet för specifika proteiner kan processen selektivt detektera ett målprotein även i en blandning av 300 000 olika proteiner.
Nackdel: utsatt för falska eller subjektiva resultat
Trots sin känslighet och specificitet kan en western blot fortfarande ge felaktiga resultat. Ett falskt positivt resultat när en antikropp reagerar med ett icke avsedd protein, vilket är vad som ofta händer när en patient som testas för HIV råkar ha tuberkulos eller ett antal parasitinfektioner. Ett falskt negativt kan å andra sidan lätt uppstå om större proteiner inte ges tillräckligt med tid för att överföra ordentligt till membranet. Felaktig blotting och bearbetning producerar ofta snedställda, bleknade eller till och med flera band, vilket gör testresultaten föremål för teknikerens tolkning.
Nackdel: hög kostnad och teknisk efterfrågan
Kostnaden för en western blot är en sammansättning av de stora enskilda utgifterna för märkta antikroppar, skickliga analytiker och laboratorieutrustning. En delikat process, western blotting kräver precision i varje steg för korrekt identifiering av provets beståndsdelar. Ett mindre fel i reagenskoncentrationen eller under inkubationsperioden kan vara katastrofalt för hela processen. Slutligen kan den utrustning som krävs för detektering och avbildning - kemiluminescerande, fluorescerande, radioaktiva eller laserdetekteringssystem - vara för dyr för den genomsnittliga mikrobiologiska enheten.