Innehåll
Om du är student i genetik har du troligtvis lärt dig att gener ofta finns i flera olika versioner (vanligtvis två) som kallas "alleler", och att en av dessa alleler i allmänhet är "dominerande" över den andra, den senare benämns " recessiv "kopia. Du vet att alla bär omkring två alleler för varje gen och får en allel från varje förälder.
Sammantaget innebär dessa fakta att om du har föräldrar med en känd genotyp för genen i fråga - det vill säga, du vet vilka alleler de kan bidra med - kan du använda grundläggande matematik för att förutsäga sannolikheten för att ett barn av dessa föräldrar har en given genotyp, och i förlängningen, chansen att något barn kommer att visa en viss fenotyp, som är det fysiska uttrycket för genetiskt kodade drag.
I verkligheten släpper reproduktiv mikrobiologi dessa nummer på grund av ett fenomen som kallas "rekombination".
Enkel Mendelian ärft
Antag att i en art av söta utlänningar är lila hår dominerande över gult hår och att dessa alleler representeras av bokstäverna P och p. Anta på liknande sätt att runda huvuden (R) är dominerande jämfört med platta huvuden (r). Baserat på den här informationen, om du vet att varje förälder är heterozygot för båda dessa egenskaper - det vill säga både moren och fadern har en dominerande och en recessiv allel både på hårfärgenens läge (lokus) och huvud- form gen locus - då vet du att varje förälder har genotypen PpRr, och att de möjliga genotyperna till avkomman är PPRR, PPRr, PPrr, PpRR, PpRr, Pprr, ppRR, ppRr och pprr.
En Punnett-kvadrat (visas inte; se Resurser för ett exempel på en dihydridkors av denna typ) avslöjar att förhållandet mellan dessa genotyper är 1: 2: 1: 2: 4: 2: 1: 2: 1, vilket i sin tur ger ett fenotypiskt förhållande på 9: 3: 3: 1. Det vill säga att du för varje 16 totala barn som produceras av dessa föräldrar kan förvänta dig nio purpurfärgade, rundhåriga barn; 3 lila-haired och platt-head baby; 3 gulhåriga, rundhåriga barn; och 1 gulhårig, platt huvud. Dessa förhållanden räknas i sin tur ut till 9/16 = 0,563, 3/16 = 0.188, 3/16 = 0.188 och 1/16 = 0.062. Dessa kan också uttryckas som procenttal genom att multiplicera med 100.
Emellertid introducerar naturen en kritisk rynka i dessa nummer: Sådana beräkningar antar att dessa alleler ärvs oberoende, men fenomenet "genkoppling" ökar detta antagande.
Genlänk: Definition
Gener som ligger nära varandra som kodar för olika egenskaper kan överföras som en enhet tack vare en process som kallas "rekombination", som sker under sexuell reproduktion som en del av ett utbyte av genetiskt material som kallas "korsning över". Sannolikheten för att detta händer i ett par gener är relaterat till hur fysiskt nära varandra generna är på kromosomen.
Tänk på en liten regnstorm som inträffar i din stad när alla råkar vara ute och gör olika saker. Om du fastnar i regnet, vad är chansen att en slumpmässig utvald vän också kommer att vara bland de blötläggna? Det beror naturligtvis på hur nära du den valda vännen råkar vara. Genbindning fungerar i enlighet med samma grundprincip.
Rekombinationsfrekvens
För att bestämma hur nära varandra på en gen använder två alleler reproduktionsdata ensam - det vill säga för att lösa genkartläggningsproblem - forskare tittar på skillnaden mellan de förutsagda fenotypiska förhållandena i en population av avkommor och de faktiska förhållandena. Detta görs genom att korsa en "dihybrid" förälder med ett avkomma som visar båda recessiva egenskaper. När det gäller vår främmande kopplingsbiologi, betyder detta att korsa en purpurhårig, rundhårig främling (som, i fallet med en dihybridorganism, har genotypen PpRr) med den minst troliga produkten av en sådan parring - en gul- hårstrå, platt huvud främmande (pprr).
Anta att detta ger följande data för 1 000 avkommor:
Nyckeln till att lösa problem med kartläggning av kopplingar är att inse att avkomman som är fenotypiskt lika som endera föräldern är det rekombinanta avkommet - i detta fall lilahåriga, rundhåriga avkommor och gulhåriga, platthuviga avkommor. Detta möjliggör beräkningen av rekombinationsfrekvensen, som helt enkelt är rekombinanta avkomm dividerat med totala avkommor:
(102 + 98) ÷ (102 + 396 + 404 + 98) = 0.20
Genetiker beräknar motsvarande procentsats för att tilldela graden av genetisk koppling, som har enheter "centimorgans" eller cM. I detta fall är värdet 0,20 gånger 100 eller 20%. Ju högre antal, desto närmare är generna fysiskt kopplade.